De retour dans le présent, la Bat-famille découvre que le Japon a disparu et qu’une île géante du nom de « Hinomoto » plane au-dessus de Gotham City. Ce monde est dominé, sans honneur et sans humanité, par la Ligue Yakuza, un groupe d’individus aux superpouvoirs qui ressemblent étrangement à la Ligue des Justiciers. Il revient maintenant à Batman et à ses alliés de sauver Gotham!